物流系統是由許多不同層次的系統組成的,各個層次在地位與作用、結構與功能上表現出等級秩序。按照物流范圍的不同,物流系統可以構成一個完整的層次秩序,即國家一級物流系統→省市一級物流系統→企業物流系統。高一級的物流系統包含低一級的物流系統，在進行物流規劃時應該表現出這種層次性。其主要表現在：
　　第一，國家一級的物流規劃,應是著重以物流基礎設施和物流基礎網絡為內容的物流基礎平臺規劃,應當和國家基礎設施建設的國策相吻合。這個物流基礎平臺的規劃，應當從現代物流綜合的角度進行全面的規劃,組建綜合的網絡，其中包括不同運輸方式線路的合理布局和使網絡發揮更大效用的綜合物流結點－－物流基地，以及相應的綜合信息網絡。
　　第二，省、市一級的物流規劃，應當著重于地區物流基地、物流中心、配送中心三個層次的物流結點以及綜合的物流園區規模和布局的規劃。物流基地、物流中心、配送中心三個層次的物流結點是省、市物流外結內連的不同規模、不同功能的物流設施，也是較大規模的投資項目。這三個層次物流結點的規劃是省、市物流運行合理化的重要基礎。
　　第三，企業的物流規劃，應當著重于“物流支持營銷”的規劃。生產企業，尤其是大型生產企業，從“營銷支持”和“流程再造”角度進行物流系統的建設規劃，會有效地提高企業的素質，增強企業的運營能力。
　　鑒于我國仍然處在計劃經濟向社會主義市場經濟轉軌的時期，部門體制所形成的局部利益，部門分割現象仍然存在，物流規劃應當由部以上的更權威的、更綜合的機構去組織和制定。在省、市、自治區，應當由地區政府統籌物流規劃事宜。應優先做好高一級的物流系統的規劃,即國家一級,這樣能夠更有效,更合理地解決我國物流系統中不合理的地方。
　　在物流規劃中應加強對運輸基礎設施的統一規劃
　　在物流系統中，運輸基礎設施屬于基礎平臺，其合理統一的配置是物流系統高效運作的前提。在物流運輸資源稀缺的情況下,需要由政府對物流運輸基礎設施進行統一的規劃和建設。
　　我國多年來在計劃經濟體制下，物流業的管理權限被分別劃歸成若干個部門。如鐵路、公路、航空、海運等運輸資源，分別直屬鐵道部、交通部、航空總局、海運局等統轄。這幾種基礎運輸方式之間的規劃發展，由于條塊分割嚴重而無法做到科學有效的統一配置，資源浪費驚人。比如，北京市在做物流系統發展規劃時，交通部、鐵道部兩個基礎設施部門各自進行研究，缺乏彼此聯系。由于北京鐵路樞紐建設比公路發展得早，因而在北京，鐵路樞紐比公路一級樞紐離城市要近一些，這樣鐵路樞紐竟然被圈在公路樞紐之內。因此，在物流規劃中，打破部門之間的限制、加強協調、進行統一規劃，就顯得極為重要。否則，這種各自為政進行的規劃會使資源始終得不到整合，資源的浪費會繼續加重，長此以往，各部門的投資會被固化，那時造成的損失是難以彌補的。
　　為此，在我國現代物流業剛開始發展的時候，國家新一輪的基礎設施建設開始的時候，應該首先作好物流發展的整體統一的規劃，克服以前條塊分割的局面。應該從建立全國的綜合物流基礎設施網絡體系的角度出發,根據市場經濟發展的需要,確定鐵路、公路、航空等的不同戰略分工,使它們的干線網互相錯開、互相銜接而不是重疊,然后再建設一些鐵路、公路、航空互相連接的樞紐站或是樞紐航空港,通過鐵路、公路支線運輸將它們連接起來,這樣各種運輸方式才能起到互補的作用,物流運輸資源才能得到最大的利用。而這種統一的規劃,需要打破體制上的障礙，需要從國家利益而不是鐵路、公路或是民航的部門利益出發。目前,可以采取下述對策來達到部門之間的這種統一規劃：
　?。ǎ保┛梢栽O立全國物流規劃的組織或辦事機構,來統一協調。
　?。ǎ玻┛梢杂蓢野l展計劃委員會和經濟貿易委員會來進行組織統籌安排。
　?。ǎ常┛梢砸箬F道部、交通部等在制定發展規劃時,特別要注意物流基礎設施和物流結點上的一體化考慮。
　　（４）各部門在制定規劃時,應防止部門利益的干擾,要采取專家介入的決策機制,尤其是要有部門外專家論證的程序。
　　在物流規劃中應注意物流結點的建設
　　物流系統的網絡由點和線這兩個基本要素組成。在物流點上主要包括單一功能點、復合功能點和樞紐點,這三點在功能上不斷完善,在物流網絡結構中的輻射范圍也不斷擴大,規劃、設計和管理的難度也逐漸加大。連接物流網絡中的結點的路線就構成了線，鐵路、公路、水路和航空都屬于物流網絡的線;物流基地、物流中心和物流園區都屬于物流的點。我國在物流網絡建設方面,目前還存在著不平衡,在硬件的投入上偏重于線的建設,比如到２００２年，我國基本建成了“二縱二橫三條重要路段″的國道主干線，總里程達到１．７萬ｋｍ,但忽略了物流基地、物流中心的建設。由于物流結點的建設明顯落后于線的建設,物流系統點與線沒有結合好,使得我國物流資源分散、封閉,物流網絡缺乏聯系和動態性。因此在當前我國物流狀況比較落后的情況下,建設一些連接多種載體的樞紐點對于形成全國統一、開放和先進的物流網絡具有戰略意義。因此,在物流規劃時,應加大對于物流基地和物流中心的規劃和建設,通過這些結點將各種物流網絡線連接起來,更充分地發揮物流網絡的作用。
　　政府在對物流基地和物流中心等物流結點進行統籌規劃時,應該首先考慮交通干線、主樞紐規劃的建設,通過調查生產力布局和物流現狀?熏并根據各種運輸方式銜接的可能性,在全國范圍內進行規劃,主要考慮其空間布局、用地規模和未來發展。
　　目前,有許多城市制定了物流發展規劃，都對自己的物流中心、物流基地和物流園區進行了規劃。這些物流結點的建設將會提高這些城市的整體物流水平。但是如果從物流運作的功能整體和跨邊界的特點來看,以城市的行政區劃為基礎來制定物流結點的規劃具有局限性,可能會出現物流結點分布過密或者物流結點的作用不大的情況?熏從而影響整體的物流效果。因此建議應以市場輻射區域或經濟地理區域為基礎對物流結點進行發展戰略規劃,充分考慮區域經濟的輻射范圍和能力。如珠江三角洲地區市場、長江三角洲地區市場、東北地區和西南地區市場等。顯然,這樣的發展戰略規劃必須由政府來協調組織制定。
　　在物流規劃中應注重物流人才培養體系的完善
　　物流系統中，人才因素是系統整合的關鍵要素。物流技術的創新和物流系統的運作需要具有綜合素質的物流專業人才。而由于我國長期以來對物流發展重視不夠，物流方面的人才缺乏，物流教育水平比較低,學科體系不健全,物流從業人員的素質亟需提高。政府應該在物流規劃中包含物流人才的培養,為我國的物流發展增加人才儲備?熏以適應我國物流快速發展的需要。主要是規劃好物流人才的培養體系，其中包括學歷教育與非學歷教育:一方面要在高校拓展設置物流管理專業，資助扶持高校和科研機構在物流領域的研究和創新活動；另一方面要支持行業協會舉辦從業和執業培訓，建立物流行業的職工終生教育系統，既滿足中國現代物流業的專業人才需求，又保證行業升級發展的人員素質提高。